1909年，伊藤博文暗杀事件因神秘人物井上源现身而被阻止，人类历史自此改写。到2009年，整个东亚地区都成了日本帝国的领土，汉城成为日本极为重要的第三大城市。韩裔“日本人”板本正行（张东健）是日本调查局的忠诚特务，他的好友兼搭档是西乡将二郎（仲村亨），其劲敌是名为“朝鲜自由”的地下抗日组织。“朝鲜自由”对井上美术博物馆发动恐怖袭击，板本正行奉命调查，一块来自石器时代、出土于中国哈尔滨的石头“月灵”，让他意外发现日本帝国隐藏百年的大阴谋，他因此重新选择人生道路，还与西乡将二郎从朋友变为敌人。