外宇宙突然出现神秘光线，朝着地球不断推进。那光球飞行物体掠过各行星，行星前哨基地的通信随之相继中断。紧接着，它迅速逼近地球。地球方面发射迎击导弹进行抵抗，却毫无效果。最终，它悠然降落在地球上，竟是一枚超大型导弹。随后，庞大的舰队突然对地球发起攻击，地球舰队无力招架，瞬间覆灭，地球也在顷刻间被征服。 暗黑星团帝国要求地球人说出大和号的下落，还以超大型导弹相威胁，称其装载的重核子炸弹能破坏地球的中子质量，让人类的脑细胞全部死亡。 古代等大和号的船员们在英雄之丘集结，森雪带来地球防卫军长官的绝密命令，众人遂向小行星伊卡洛斯进发。然而，森雪途中受伤，不得不独自留在地球。成功从地球拼死逃脱的一行人抵达伊卡洛斯后，却……