故事始于墓地，霍雷肖·凯恩（Horatio Caine）正在教堂向神父忏悔，这时外面传来一阵枪声……案件虽成功侦破，但也为季末剧情埋下了伏笔。 本季增添了一些犯罪现场调查员（CSIer）的故事。埃里克·德尔科（Eric Delko）卷入了一起大麻事件，遭到了内务部的调查。瑞安·沃尔夫（Ryan Wolfe）在一次调查中眼睛被针射中，视力受到影响。霍雷肖·凯恩因埃里克的事情结识了他的姐姐玛丽（Mari），最终二人结为夫妻。而本季的主线是实验室里出现了内奸，这使得实验室里人心惶惶，内奸将在第25集揭晓。 此外，第25集也为下一季做了铺垫。第1集中出现的黑帮为报复霍雷肖，射杀了他的妻子。由于联邦调查局（FBI）介入，黑帮分子被押送至巴西，霍雷肖和埃里克决定前往巴西将其绳之以法。