在赛博坦星球内战结束约数世纪后，汽车人（Autobot）和霸天虎（Decepticon）分别演变成了巨无霸（Maximal）和原始兽（Predacon）。一位与霸天虎领袖同名的原始兽将军——威震天（Megatron），伙同其他5个原始兽成员偷走了能指明主要能源所在地的金盘，随后驾驶飞船（黑暗星舰），依据金盘上的信息进行超时空跳跃，前往金盘指定的时空。威震天希望获取足够能量，让原始兽称霸宇宙。以擎天圣（Optimus Primal）为首的巨无霸科学探索小队接到命令对其进行拦截。威震天无视星际法律，强行进行超时空跳跃，双方最终坠落在史前地球（起初他们都没意识到这是地球）。 双方都探测到这个星球有强大的原生能量，但这种能量对他们有害。由于记载中未提及这些能量，他们没意识到这里是地球。为抵御能量干扰，他们扫描地球生物，并以生物形态作为变形形态。而星球的能量让威震天的野心愈发膨胀，他开始带领原始兽掠夺能量。为了自身安全和生存，以擎天圣为首的巨无霸小队展开反击。 随着战斗推进，一些奇异情况被发现，原来史前地球是外星人——沃克人（Vok）的试验场。外星人抓住擎天圣并对他进行扫描。因为擎天圣是穿越时空来到此地，沃克人通过扫描看到了未来，连宇宙大帝都被击败，于是心生恐惧，决定摧毁这里。天上的两个月亮之一开始变形，原来这是外星人的终极武器。擎天圣决定登上平衡舱去炸毁外星人的量子武器，却中了狼蛛和威震天的计，他和外星人的武器一同被炸得粉碎，引发了一场量子风暴。后来，犀牛冒着生命危险拉回擎天圣的火种，并植入一个空白的原生体，使擎天圣复活并成为金属变体。外星人消失了，但危机仍未解除。 根据金盘记载，人类曾帮助汽车人打败霸天虎，而原始人类会在某个山谷出现，峡谷中的原始人就是人类的祖先。为改变历史（未来），威震天决定消灭这些原始人。但在恐龙勇士（Dinobot）的努力下，原始人逃过一劫。更惊人的是，坠毁在史前地球上的汽车人飞船——方舟（the Ark）被发现了。至此，双方确定这里就是史前地球。此时，汽车人还在方舟中沉睡。威震天摧毁了擎天柱（Optimus Prime）的头部，引发超级时空风暴，妄图改变历史。但犀牛和黄豹等人修复了擎天柱，确保了历史正常发展。