在《少年包青天》第二部中，包拯（陆毅 饰）已不再是当初那个青涩冲动的少年，而是成为了一位稳重且有担当的县城父母官，在一方土地上为百姓请命。某一天，他接到皇上的紧急召回，要回京城查办收受贿赂、贪污的官员接连死亡的案件。少年包青天再度出击，在前往京城的路上，他结识了王朝、马汉、张龙、赵虎，这些人日后都成了包公身边大名鼎鼎的护卫。公孙策（任泉 饰）早已对包拯的聪明才智心服口服，心甘情愿地辅佐他办案。此次他们遇到了惯偷小蜻蜓（范冰冰 饰），她性格活泼、爱捣蛋，身份十分神秘。直到调查大画家冯止水相关事件时，大家才了解到小蜻蜓身世悲惨：收养她的义父从小对她视如己出，还为她画了《牡丹亭上的少女》，画中藏有一个秘密。后来义父失踪于江湖，音信全无。多年来，小蜻蜓想尽办法寻找义父下落却一无所获，这次只能寄希望于包拯能查明事情真相。