清代康熙年间，少林俗家弟子洪熙官 （ 李连杰 饰）屡与贪官污吏作对，被作为头号追杀人物。由于同门马宁儿的出卖，致使熙官全家被杀，仅留幼子文定。马宁儿又想向熙官施暗算，被熙官毙于枪下。从此，熙官携幼子浪迹天涯。八年后。少林寺至善禅师获一藏宝图，可用以对抗清廷。为防清廷抢夺，把藏宝图分开文于马超兴、胡德帝、蔡德忠、李式开、方大洪等年幼五祖背上，又密函知会洪熙官护送五祖往寻天地会陈近南总舵主。朱小倩和红豆母女专以行骗为生，一次遇上马超与其父马佳善，她们以卖身葬母为由设下骗局。马佳善中计将红豆买回，碰见洪熙官父子，见其勇武，请其当护院。朱小倩母女怕洪熙官揭破骗局，心生杀意，反被洪熙官制服，熙官怕母女俩生事而不去揭穿她们底细。少林寺被清兵围攻，突然出现一恐怖怪人大闹少林寺。恐怖怪人就是被西域妖僧救走并用毒水浸泡使其刀枪不入的马宁儿，杀死不肯透露藏宝图去向的至善。少林寺被毁，五祖逃至马家庄，追兵跟踪而至，马家庄顿时成为战场。朱小倩领五祖在小巷中与清兵激战，将领兵官和大批高手除去，自己也中毒镖而亡。洪熙官父子双战马宁儿不敌，洪熙官的师叔随后出现拖住马宁儿。文定舍命刺瞎马宁儿一只眼，洪熙官在马宁儿捉文定时乘势用无影脚将马宁儿踢入熔炉，大仇终于得报，藏宝图安然无恙。