健太郎在一家大型企业的企划开发部工作，他一直暗自喜欢同部门的女同事梦香。一天夜里，健太郎目睹梦香遭到地痞流氓袭击，他不顾自身安危想要救她，结果却被打得狼狈不堪。危急时刻，伊贺忍者后裔羽目鸟映藏出手救下了两人。 从那天起，映藏和他的忍犬“ムクマロ”就住进了健太郎的公寓。与此同时，神出鬼没的甲贺女忍者军团盯上了健太郎。她们的目的是盗取健太郎正在研发的新产品资料，然后高价卖给竞争公司。