故事设定为改写了机动战士高达（元祖高达）的一年战争发展的平行世界，在吉翁得势的五年后宇宙世纪0085年开始。 本作品在一座并未加入吉翁的太空居民点开始，描写女高中生主角天手让叶，在与难民少女尼娅安相遇后被卷入非法MS决斗竞技“军团战”，驾驶着神秘最新型MS“GQuuuuuuX”投身其中，而被通缉的神秘MS“高达”驾驶员修司也出现在她们面前。