悪の秘密結社バゴーンによる連続爆破テロが発生し、至急現場に駆け付けたギンガイガーは最新戦術システムギンガネットと連携しバゴーンの怪人「エビル」を倒すが、エビルのマスクの下に隠されていたのはかつてギンガジュニアのメンバーだった安孫しげるだった…。